Em 2005, um grupo de professores aposentados da Universidade Federal do Acre, engajados na formação dos seminaristas do Estado, dão início a Faculdade Diocesana São José, com sede no próprio Seminário Maior, com o curso livre de Teologia. O mesmo foi reformulado para atender aos dispositivos legais e apenas em 2012 autorizado pelo Ministério da Educação. Em 2009, foi autorizado o curso de Filosofia Bacharelado, tendo em 2015, sua primeira turma formada, e o reconhecimento do curso. Destaca-se que o curso de Filosofia foi reconhecido com a nota 3 (de 0 a 5) e Teologia nota 4.

               Em 2010, com a revitalização do Centro de Formação da Igreja Católica, a Fadisi muda de endereço, onde está até hoje, na Avenida Getúlio Vargas, Vila Ivonete. Conta com um grupo de 20 professores, sendo que mais de 50% com titulação stricto sensu e uma ótima estrutura física e pedagógica para a oferta de ensino com qualidade, com base no nos preceitos éticos, humanísticos e cristãos que dissemina a Igreja Católica.